较真丨法国发现新的变异新冠病毒,核酸检测查不出,是真的吗?

   日期:2021-03-22     浏览:0    
核心提示:较真要点:法国变异新冠病毒株仍然可以通过核酸检测发现,并没有出现所谓“逃避核酸检测”的能力。目前因变异导致核酸检测失灵的

较真要点:

法国变异新冠病毒株仍然可以通过核酸检测发现,并没有出现所谓“逃避核酸检测”的能力。目前因变异导致核酸检测失灵的概率非常低。

查证者:庄时利和丨国家执业医师,神经科学硕士

最近有媒体报道称“法国发现新的变异新冠病毒,可以逃避核酸检测”,引发广泛关注。据法国卫生部公布的信息,布列塔尼一家企业内部发现聚集性感染,其中8例患者被发现携带新的变异新冠病毒。这8名患者虽然有典型的感染症状,但其此前鼻咽样本核酸测试呈阴性。该新变异株的S蛋白以及其他病毒区域中共携带9个突变。

为什么核酸检测未能测出病毒?是变异导致的吗?自新冠爆发以来核酸检测就是各国最常用的检测手段,如果法国变异株真如报道所说能逃过核酸检测,会不会引发新一轮的疫情流行?

一、变异病毒此前为什么没被检测出?先从两个基础知识点说起:第一,我们用什么方式检测新冠病毒,第二,我们取什么样的标本检测新冠病毒

先说第一个知识点,核酸检测是病毒检测的一种方式,但两者不能完全等同。

病毒是由里面的核酸和外面的蛋白质外壳两部分组成。病毒的个头很小,比如新冠病毒只有100纳米左右,大概是头发丝直径的六百分之一,所以我们很难直接检测活病毒,这个过程需要用到电子显微镜,还有其他更复杂的处理方式。

因此使用更多的便是核酸检测,现在已经有了很成熟的核酸检测方法,比如RT-PCR技术。样本中的病毒核酸其实是很少的,RT-PCR的目的是将微量的特定核酸片段进行大幅扩增。在这个不断循环扩增核酸片段的过程中,达到阈值所需要的循环(cycle)越少,说明样本中特定核酸的含量越高。

第二个知识点,我们取什么标本进行检测?

我们现在采样的标本,包括鼻咽拭子、口咽拭子、肛拭子、深部痰以及肺泡灌洗液等。一个好的标本,应当容易采样,同时病毒载量(viral load)比较高。

但实际上,很难有样本能完美符合这个要求。从取样难度来说,深部痰和肺泡灌洗液远远难于鼻咽/口咽拭子,但检测准确度较高。而比较鼻咽拭子和口咽拭子,大多数人往往更愿意选择后者,因为鼻咽拭子检测起来比口咽拭子难受多了。

之前有研究人员对213名新冠肺炎住院患者进行口咽拭子和鼻咽拭子测试,鼻咽拭子的阳性检出率明显高于口咽拭子。

图注:轻重症患者口咽拭子/鼻咽拭子检出率对比 数据来源:Xiong, W. A. , Li, T. B. , Xu, W. A. , Wl, A. , Yl, A. , & Lc, A. , et al. (2020). Comparison of nasopharyngeal and oropharyngeal swabs for sars-cov-2 detection in 353 patients received tests with both specimens simultaneously - sciencedirect. International Journal of Infectious Diseases, 94, 107-109. 图片作者自制

即便对已经确诊住院的患者而言,鼻咽拭子和口咽拭子的核酸检测仍然会有假阴性的结果出现。另外,在人体感染新冠病毒后的不同时间,不同样本中能检测到病毒的概率也是一直变化的。比如根据发表在JAMA上一篇关于新冠病毒诊断测试的研究,深部呼吸道样本(肺泡灌洗液和深部痰)持续阳性的时间就比鼻咽拭子更长。

总结一下,核酸检测并不是直接检测活病毒,检测过程受到样本病毒载量的影响,人感染病毒后,不同样本中能检测到病毒的概率也并非恒定,所以核酸检测并不能保证百分百准确,存在假阴性的可能。

二、法国变异病毒未能“逃避核酸检测”,目前因变异导致核酸检测失灵的概率非常低

说完采样的问题,我们再来看看法国的情况。根据法国卫生部公布的信息,病毒变异导致核酸检测失效的可能基本排除了。但仍有很多媒体报道的标题是“法国发现变异病毒能逃避核酸检测”,这并不是事实的真相。

很简单的一点,如果病毒逃避了核酸检测,那我们怎么知道患者是感染了新冠?实际上,法国这8名患者虽然鼻咽拭子核酸检测是阴性的,但是深部呼吸道样本的核酸检测结果是阳性的。

这就说明一点,法国变异株并没有出现所谓“逃避核酸检测”的能力。实际上目前新冠病毒核酸检测试剂盒都是以ORF1a/b为最主要目标基因(一些厂商会再加上N、E或S基因),而ORF1a/b基因为RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)基因所在区域,编码RNA聚合酶,负责病毒核酸复制——这是一个相对保守的区域。如果新冠病毒突变到逃避试剂盒检测,目前来看概率还是非常低的。

而鼻咽拭子测试阴性、深部呼吸道样本测试阳性,这种情况也并不少见。一些变异株会加重这种现象,比如病毒载量低、在上呼吸道停留时间短等,都有可能导致鼻咽拭子测试阴性。

根据法国卫生部的公告,这次的变异株是来源于Clade20C病毒株,现在的初步分析不能表明新变异株具有更高的传染性,或者更强的致病能力。法国已将其列入了监测名单,但没有列入“值得担忧的变异株类型”,后者目前只有英国变异株(B.1.1.7)、南非变异株(B.1.351)和巴西变异株(P.1)等少数几种。

大家没有必要对变异病毒株过于担心。我们在过去的一年中,已经发现了接近三万个突变,绝大多数突变是没有实际意义的,只有几十个突变会改变病毒的传播能力或致病能力。而即便是这样的突变,通过疫苗接种和有效的社会防控来控制其传播,仍是有效的。

本文编辑:ambergchen

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